Hai năm sau khi Ethan Hunt đã bắt thành công Solomon Lane, tàn dư của Syndicate đã cải tổ thành một tổ chức khác gọi là Tông đồ. Dưới sự lãnh đạo của một nhà cơ bản bí ẩn chỉ được gọi là John Lark, tổ chức đang lên kế hoạch mua ba lõi plutonium. Ethan và đội của anh ta được gửi đến Berlin để chặn họ, nhưng nhiệm vụ thất bại khi Ethan cứu Luther và các sứ đồ trốn thoát với plutonium. Với Đại lý CIA August Walker tham gia nhóm, Ethan và các đồng minh của anh ta bây giờ phải tìm các lõi plutonium trước khi quá muộn
